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1.HIV-1感染的诊断（窗口期3-7天）：婴儿感染早期诊断；HIV-1感染补充试验及急性期和晚期感染者的诊断。
2.病情进展和抗病毒治疗疗效预测及预后评估：HIV-1 DNA具有独立于CD4和病毒载量（HIV-1 RNA）的疾病预测价值；治疗前HIV-1 DNA水平能预测患者对抗病毒治疗的病毒学、免疫学和临床应答；预测部分HIV-1相关疾病的发生。
3.评估临床治疗新策略：探索简化治疗的适应征；储存库清除策略的主要评价指标之一；预测功能性治愈停药复发的可能性。
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